Der zehnjährige Magier Negi Springfield hat gerade seinen Abschluss gemacht und muss zur Weiterbildung eine zugewiesene Beschäftigung bewältigen.
Negi bekommt einen Posten als Lehrer in einer Mädchen-Mittelschule in Japan.
Jedoch wird seine Autorität von seiner Klasse meist untergraben, da er selbst den Mädchen nicht mal zum Brustkorb reicht.
So wird er zum Spielzeug der 30-köpfigen Mädchen-Klasse.

Jedoch passiert, dass eine Schülerin,Kagurazaka Asuna entdeckt, dass Negi ein Magier ist. Dadurch entsteht eine “Hass-Freundschaft” zwischen den beiden.
Es erfahren immer mehr Schülerinnen aus seiner Klasse, dass er ein Magier ist und es entwickelt sich eine kleine Armee, die Negi täglich auf den Geist gehen.