Utena Tenjou ist Schülerin im extrem vornehmen Ohtori-Internat. Ihre Eltern sind gestorben als sie noch sehr jung war, und ein geheimnisvoller Prinz half ihr damals über die Trauer hinweg.
Er gab ihr einen Ring mit einer Rose darauf, der sie später einmal zu ihm führen sollte. Voller Bewunderung für diesen Prinzen fängt sie an, sich wie ein Junge zu kleiden und zu
verhalten. Auf dem Internat gerät sie in ein Duell und dadurch in den Kreis einer mysteriösen Studentenverbindung.

Diese wird von einem geheimnisvollen Rat der Amageddon unterstützt und
unterliegt den Regeln des Siegels der Rose…
Von der Meisterhand Kunihiko Ikuharas geführt, tauchen wir mit Utena in eine träumerische, von Ritterlichkeit geprägte Welt..